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Laboratory - Biologie du Développement de Villefranche sur mer
Unité Mixte de Recherche CNRS 7009

Tutorship

UPMC

UPMC

CNRS

Developmental Biology Research - UMR7009 BioDev - CNRS

UMR7009 CNRS/UPMC Laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche sur mer
Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer
Quai de la Darse, 06234 Villefranche-sur-Mer Cedex, France
Téléphone : +33 (0)4 93 76 37 70  +33 (0)4 93 76 37 79
Télécopie : +33 (0)4 93 76 37 92

 

In this page

Research activities

- Culture of adults and embryos of marine model species, both traditional and new emerging models.  Occasional work on other wild species, exploiting the unique biodiversity of the bay of Villefranche-sur-mer.

 - Identification of new molecular actors involved in early development (using methods of biochemistry, cloning, sequencing, screens, in situ hybridizations, etc…).

 - Functional studies of regulators of gametogenesis and early embryogenesis; generation of gene regulation networks.

- Generation and analysis of genomic sequencing for the major marine models used : the sea urchin Paracentrotus lividus , the ascidian Phallusia mammillata, the jellyfish Clytia hemisphaerica.

- In vivo imaging of tagged fluorescent proteins, of calcium signals and other physiological indicators, of organelles and the cytoskeleton (confocal microscopy and videomicroscopy, image analysis).

- Visualization and localization of cellular and macromolecular structures (electron microscopy, fast freezing, immunolocalization, in situ hybridization).

 

Keywords

Marine embryos, embryonic determinants, gene regulation network, asymmetric cell division.

Teams and research themes

“Maternal determinants” (teamleader Evelyn Houliston)

This group is interested in “determinants” localized in eggs: their nature, functions and the cellular mechanisms responsible for their differential distribution within the cell and throughout the embryo.

The main species used for study is the small jellyfish Clytia hemisphaerica, a new experimental model developed in the lab. The amphibian Xenopus laevis is also used for comparative studies.

 

Regionalization and morphogenesis of the sea urchin embryo (teamleader Jenifer Croce)

This group studies the molecular and cellular mechanisms controlling the specification and the morphogenesis of cell lineages forming the endoderm and mesoderm in the sea urchin Paracentrotus lividus.

Work is directed towards identifying the nature of the signaling pathways (Notch, Wnt, Vegf, etc) and the transcription factors (Brachyury, FoxA, GataE, SoxC, etc) which regulate these embryonic processes. The goal is to establish a 4 dimensional model which represents the molecular data and cellular events involved in these mechanisms.

 

Fertilization and control of meiotic cell cycle (teamleader Alex McDougall)

Using principally the ascidians Ciona intestinalis and Phallusia mammillata, this group is currently pursuing two avenues of research:

1. The regulation of the cell cycle during oocyte maturation, and chromosome segregation during the meiotic cell divisions.

2. The generation of calcium oscillations in the egg caused by the entry of the sperm.

 

BioMarCell group: Fertilization and polarization of marine invertebrate embryos (teamleader Christian Sardet)

This group is interested in the mechanisms responsible for cell polarity and early embryonic development in ascidians. Current research is focused on:

1. Acquisition of the primary oocyte polarity during meiotic maturation.

2. Polarization of the zygote after fertilization and its consequences for establishment of axes of the tadpole.

3. The polarized distribution of the cytoskeleton, organelles, and cortical mRNAs and the regulation of their translation.

4. The patterns of asymmetric cell divisions at the posterior pole which segregate muscle and germ line fates.

 

“Specification of embryonic precursors” (teamleader HitoyoshiYasuo)

 

“Regeneration and pluripotency” (teamleader Stefano Tiozzo)

 

 

Active projects

ANR – Equipe  Lepage : Dissection of the dorsal-ventral Gene regulatory Network in the sea urchin embryo. (acronyme : DVNETWORK), 01/01/2009 au 31/12/2012 (48 mois)

 

ANR - Equipe MacDougall (Collaboration avec M-H Verlhac, UMPC UMR 7022 responsable) : A proteomic approach of meiotic divisions of oocytes (acronyme  MetaOneProteome), 01/01/2009 au 31/12/2012 (48 mois)

 

ANR - Equipe Yasuo : Dissection of developmental processes leading to the chrodate body plan (acronyme : ChordateForm), automne 2009 (48 mois)

 

ANR - Equipe Houliston (Collaboration avec M  Manuel, UMPC, UMR7138, responsable). L’origine des processus fondamentaux du développement animal : approche évo-dévo sur les modèles émergents Clytia hemisphaerica (cnidaire) et Pleurobrachia pileus (cténaire) (acronyme : DiploDevo), automne 2009 (36 mois)

 

ARC  équipe Lepage : Rôles du répresseur transcriptionnel Yan/Tel6 et de son modulateur Mae dans le contrôle de la transition épithélium mésenchyme et l’établissement de la polarité dorso-ventrale. 08/01/2008 (24 mois)

 

ARC  équipe Sardet-ARN et protéines corticales : rôles dans la polarisation et la différenciation cellulaire. 08/01/2008 (24 mois)  

 

ARC équipe Yasuo-  Les divisions cellulaires asymétriques comme mécanisme de génération de diversité cellulaire au cours de l’embryogenèse des chordés. 11/12/2008 (24 mois)

 

ARC- équipe Houliston (resp. T. Momose)  Rôles et interactions des voies Wnt/Fz canoniques dans le développement embryonnaire. 11/12/2008 (24 mois

Emergence-UPMC – Equipe Gache (resp. J. Croce) Dynamique des réseaux de gènes régulateurs du développement embryonnaire : spécification de l’endoderme et du mésoderme chez l’embryon d’oursin. 01/03/2010 (24 mois)

Main scientific results

Thierry Lepage, Research Director, was attributed the Tregouboff prize by the Academy of Sciences in 2009 for his recent discoveries on the mechanisms of embryonic axis specification in the sea urchin.   

 

Clare Hudson, Research Scientist, received the CNRS bronze medal in 2009 for her work on fundamental mechanisms which regulate embryonic development in the larvae of ascidians.  http://www.webtimemedias.com/webtimemedias/wtm_article53337.fr.htm )

 

 

Doctoral schools

ED 85  Biology and Molecular Pharmocology (University of Nice Sophia-Antipolis)  

ED 223 Complexity of Life (UPMC)

ED 392 Diversity of Life (UPMC)

 

 

Scientific parternships
Local

 

Locaux

 

La plate forme ImarioNiceNouvelle fenêtre est une entité en cour de labellisation « Ibisa », les équipements sont distribués sur deux plateaux techniques situés à Nice Varose et à Villefranche/mer. Elle offre à ses utilisateurs, l’accès aux techniques d’observations suivantes :


Microscopie non-linéaire.Nouvelle fenêtre

    La microscopie multi-photon : technique de microscopie de fluorescence qui permet d’imager des échantillons tridimentionnellement avec une profondeur d’illumination de plus de 500um),
    Microchirurgie laser : permet de détruire de manière extrêmement contrôlée un objet biologique (résolution inférieure au micron) et d'observer la réaction de l’échantillon à cette ablation
    Génération de Seconde Harmonique : technique de contraste spécifique de certaines molécules avec une organisation très structurée (fibres de collagène, myosine sarcomérique,…)

Microscopie confocale à balayage laser.Nouvelle fenêtre
Microscopie photonique offrant la possibilité d'accéder à l'information tri-dimensionnelle en fluorescence, d'un échantillon microscopique. Possibilités de mettre en oeuvre différentes techniques de photo-manipulation (FRET, FRAP, Photo activation décageage...)

Vidéomicroscopie à champ largeNouvelle fenêtre
Permet l'étude de la dynamique cellulaire. Cette technique permet notamment d'observer en images par image à des vitesses d'observation élevées (dépendant du signal de l'échantillon)

Microscopie de déconvolutionNouvelle fenêtre

Technique d'imagerie utilisant des techniques d'analyse d'images afin de faire du Z-sectionning à partir d'images de videomicroscopie.

Microscopie ratiométriqueNouvelle fenêtre

Par épifluorescence.

Stations de post traitementNouvelle fenêtre

Afin de mettre en accès aux utilisateurs des outils d'analyse d'images

National

Nationaux


Avec le Génoscope /IBISA  pour les projets  de séquençage sur nos principales espèces modèles :

Clytia hemisphaerica : Séquencage du génome complète

Phallusia mammilata : Séquencage du transcriptome

Paracentrotus lividus: Séquencage du transcriptome et de l’ADN génomique

Main publications

See the Lab Publication Database for a complete list Nouvelle fenêtre

Coordinates
Coordinates
Director
Houliston Evelyn
+33 (0)4 93 76 3983
Physical address
Observatoire Océanologique de Villefranche
Quai de la Darse
BP 48 6235
Villefranche-sur-Mer Cedex

Laboratory e-mail
Web site
http://www.biodev.obs-vlfr.fr
Postal address
Laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche sur mer
UMR7009 CNRS/UPMC
Observatoire Océanologique
Quai de la Darse, 06234 Villefranche-sur-Mer Cedex, France

Communication contact
Khamla Mohamed
04 93 76 37 73
Administrative contact
Gomez Anne-Marie
+33 (0)4 93 76 3770


Staff
Teachers - researchers :
1

Researchers :
14

Help staff :
14

Post-doctorate :
3

phD students :
6

LBDV Laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche sur mer - 18/04/14